- Ambiente y Desarrollo Sostenible
- Autonomía, Gestión y Participación
- Ciencia, Tecnología y Capacitación
- Cooperación Internacional
- Cultura
- Desarrollo Económico Local
- Desarrollo Social
- Desarrollo Urbano
- Educación
- Género y Municipio
- Integración Fronteriza
- Juventudes
- Planificación Estratégica y Áreas Metropolitanas
- Seguridad Ciudadana
- Turismo
- Grupo de Comunicación
Unidad Temática de Género y Municipio
Esta unidad temática, desde 1999, viene impulsando políticas de género que fundamentan la participación de las mujeres en el diseño de las políticas públicas y que implementan acciones positivas pendientes a eliminar las persistentes desigualdades que limitan los derechos de las mujeres.
Contando con el apoyo de UNIFEM (ONU) desde 2001, la Unidad de trabajo ha podido llevar a bien las numerosas reuniones en el marco del proyecto "Hacia una agenda regional de las mujeres: Políticas locales de género en la Red de Mercociudades"